Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:

- d -

• d_restraint_potential_dk() : colvarbias_restraint, colvarbias_restraint_harmonic, colvarbias_restraint_harmonic_walls, colvarbias_restraint_linear
• data : colvar_grid< T >, colvarparse::read_block
• data_array() : colvarmodule::matrix2d< T >, colvarmodule::vector1d< T >
• data_begin_pos : colvarparse
• data_end_pos : colvarparse
• data_length_ : cvm::memory_stream
• dcos_theta_dq() : colvarmodule::rotation
• debug() : colvarmodule
• debug_gradients() : colvar::cvc, colvarmodule::rotation
• debug_gradients_step_size : colvarmodule
• decr_ref_count() : colvardeps
• decrease_depth() : colvarmodule
• decreasing : colvarbias_abmd
• default_input_state_file_ : colvarmodule
• default_restart_frequency() : colvarproxy_io
• define_component_types() : colvar
• delete_hill() : colvarbias_meta
• delete_input_stream() : colvarproxy_io
• delete_requested() : colvarproxy
• delta_grid() : colvar_grid< T >
• denseLayer() : neuralnetworkCV::denseLayer
• depth() : colvarmodule
• depth_s : colvarmodule
• depth_v : colvarmodule
• determinant() : colvarmodule::rmatrix
• dihedral() : colvar::dihedral
• dip : colvarmodule::atom_group
• dipole() : colvarmodule::atom_group
• disable() : colvardeps
• dist2() : colvar::cartesian, colvar::CVBasedPath, colvar::cvc, colvar, colvar::distance_dir, colvar::distance_pairs, colvar::distance_vec, colvar::linearCombination, colvar::neuralNetwork, colvar::orientation, colvar::orientation_angle, colvarmodule::quaternion, colvarvalue
• dist2_grad() : colvarmodule::quaternion, colvarvalue
• dist2_lgrad() : colvar::cartesian, colvar::CVBasedPath, colvar::cvc, colvar, colvar::distance_dir, colvar::distance_pairs, colvar::distance_vec, colvar::linearCombination, colvar::neuralNetwork, colvar::orientation, colvar::orientation_angle
• dist2_rgrad() : colvar::cartesian, colvar::CVBasedPath, colvar::cvc, colvar, colvar::distance_dir, colvar::distance_pairs, colvar::distance_vec, colvar::linearCombination, colvar::neuralNetwork, colvar::orientation, colvar::orientation_angle
• dist_v : colvar::distance, colvar::distance_z
• dist_v_ortho : colvar::distance_xy
• divergence : integrate_potential
• do_feature_side_effects() : colvar, colvardeps, colvarmodule::atom_group
• done_reading() : cvm::memory_stream
• dspin_angle_dq() : colvarmodule::rotation
• dt() : colvarmodule, colvarproxy_system
• dummy_atom_pos : colvarmodule::atom_group
• dump_fes : colvarbias_meta
• dump_fes_save : colvarbias_meta
• dump_replica_fes : colvarbias_meta
• dxdr1 : colvar::angle, colvar::dipole_angle