Collective Variables Module - Developer Documentation
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get_accelMD_factor() :
colvarproxy_namd
,
colvarproxy_system
get_alch_lambda() :
colvarproxy_namd
,
colvarproxy_system
,
colvarproxy_vmd
get_atom_charge() :
colvarproxy_atoms
get_atom_group_charge() :
colvarproxy_atom_groups
get_atom_group_com() :
colvarproxy_atom_groups
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colvarproxy_atom_groups
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colvarproxy_atom_groups
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colvarproxy_atom_groups
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colvarproxy_atom_groups
get_atom_id() :
colvarproxy_atoms
get_atom_lists() :
colvar::cvc
,
colvar
get_atom_mass() :
colvarproxy_atoms
get_atom_position() :
colvarproxy_atoms
get_atom_total_force() :
colvarproxy_atoms
get_atom_velocity() :
colvarproxy_atoms
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colvarscript
get_cmd_arg() :
colvarscript
get_cmd_prefix() :
colvarscript
get_cmdline_help_summary() :
colvarscript
get_colvar_cmd_arg() :
colvarscript
get_colvars_index() :
colvar_grid< T >
get_colvars_index_bound() :
colvar_grid< T >
get_command_arghelp() :
colvarscript
get_command_cmdline_help() :
colvarscript
get_command_cmdline_syntax() :
colvarscript
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colvarscript
get_command_help() :
colvarscript
get_command_n_args_max() :
colvarscript
get_command_n_args_min() :
colvarscript
get_command_names() :
colvarscript
get_command_rethelp() :
colvarscript
get_config() :
colvarmodule
,
colvarparse
get_current_work_dir() :
colvarproxy_io
get_cvc_param() :
colvar
get_cvc_param_grad() :
colvar
get_cvc_param_ptr() :
colvar
get_d2E_dlambda2() :
colvarproxy_system
get_dE_dlambda() :
colvarproxy_namd
,
colvarproxy_system
,
colvarproxy_vmd
get_elem() :
colvarvalue
get_error_msgs() :
colvarproxy
get_frame() :
colvarproxy_io
,
colvarproxy_vmd
get_global_cvc_map() :
colvar
get_grad() :
integrate_potential
get_key_string_multi_value() :
colvarparse
get_key_string_value() :
colvarparse
get_keyval_feature() :
colvardeps
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colvarscript
get_molid() :
colvarproxy_system
,
colvarproxy_vmd
get_num_active_atom_groups() :
colvarproxy_atom_groups
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colvarproxy_atoms
get_param() :
colvarparams
get_param_grad() :
colvar::cvc
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colvarparams
get_param_grad_ptr() :
colvarparams
get_param_names() :
colvarparams
get_param_ptr() :
colvarparams
get_state_params() :
colvar
,
colvar_grid< T >
,
colvar_grid_count
,
colvar_grid_gradient
,
colvar_grid_scalar
,
colvarbias
,
colvarbias_abmd
,
colvarbias_alb
,
colvarbias_meta
,
colvarbias_restraint
,
colvarbias_ti
get_tcl_interp() :
colvarproxy_tcl
get_time_step_factor() :
colvardeps
get_value() :
colvar_grid< T >
get_vector() :
colvarmodule::quaternion
get_version_from_string() :
colvarproxy
get_volmap_id() :
colvarproxy_volmaps
get_volmap_id_from_name() :
colvarproxy_namd
,
colvarproxy_volmaps
get_volmap_ids() :
colvar
get_volmap_value() :
colvarproxy_volmaps
getGridForceGridValue() :
colvarproxy_namd
getInputSize() :
neuralnetworkCV::denseLayer
getLayer() :
neuralnetworkCV::neuralNetworkCompute
getline() :
colvarmodule
getline_nocomments() :
colvarparse
getNumberOfLayers() :
neuralnetworkCV::neuralNetworkCompute
getOutputSize() :
neuralnetworkCV::denseLayer
getWeight() :
neuralnetworkCV::denseLayer
gradient_finite_diff() :
colvar_grid_count
,
colvar_grid_scalar
grid_rmsd() :
colvar_grid_gradient
,
colvar_grid_scalar
GridForceGridLoop() :
colvarproxy_namd
group_force_object() :
colvarmodule::atom_group::group_force_object
Generated on Mon Dec 23 2024 17:18:11 for Collective Variables Module - Developer Documentation by
1.9.5