Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:
- g -
- gaussian_width : colvarbias_restraint_histogram
- get_accelMD_factor() : colvarproxy_namd, colvarproxy_system
- get_alch_lambda() : colvarproxy_namd, colvarproxy_system, colvarproxy_vmd
- get_atom_charge() : colvarproxy_atoms
- get_atom_group_charge() : colvarproxy_atom_groups
- get_atom_group_com() : colvarproxy_atom_groups
- get_atom_group_id() : colvarproxy_atom_groups
- get_atom_group_mass() : colvarproxy_atom_groups
- get_atom_group_total_force() : colvarproxy_atom_groups
- get_atom_group_velocity() : colvarproxy_atom_groups
- get_atom_id() : colvarproxy_atoms
- get_atom_lists() : colvar::cvc, colvar
- get_atom_mass() : colvarproxy_atoms
- get_atom_position() : colvarproxy_atoms
- get_atom_total_force() : colvarproxy_atoms
- get_atom_velocity() : colvarproxy_atoms
- get_bias_cmd_arg() : colvarscript
- get_cmd_arg() : colvarscript
- get_cmd_fn : colvarscript
- get_cmd_prefix() : colvarscript
- get_cmdline_help_summary() : colvarscript
- get_colvar_cmd_arg() : colvarscript
- get_colvars_index() : colvar_grid< T >
- get_colvars_index_bound() : colvar_grid< T >
- get_command_arghelp() : colvarscript
- get_command_cmdline_help() : colvarscript
- get_command_cmdline_syntax() : colvarscript
- get_command_full_help() : colvarscript
- get_command_help() : colvarscript
- get_command_n_args_max() : colvarscript
- get_command_n_args_min() : colvarscript
- get_command_names() : colvarscript
- get_command_rethelp() : colvarscript
- get_config() : colvarmodule, colvarparse
- get_current_work_dir() : colvarproxy_io
- get_cvc_param() : colvar
- get_cvc_param_grad() : colvar
- get_cvc_param_ptr() : colvar
- get_d2E_dlambda2() : colvarproxy_system
- get_dE_dlambda() : colvarproxy_namd, colvarproxy_system, colvarproxy_vmd
- get_elem() : colvarvalue
- get_error_msgs() : colvarproxy
- get_frame() : colvarproxy_io, colvarproxy_vmd
- get_global_cvc_map() : colvar
- get_grad() : integrate_potential
- get_key_string_multi_value() : colvarparse
- get_key_string_value() : colvarparse
- get_keyval_feature() : colvardeps
- get_module_cmd_arg() : colvarscript
- get_molid() : colvarproxy_system, colvarproxy_vmd
- get_num_active_atom_groups() : colvarproxy_atom_groups
- get_num_active_atoms() : colvarproxy_atoms
- get_param() : colvarparams
- get_param_grad() : colvar::cvc
- get_param_grad_names() : colvarparams
- get_param_grad_ptr() : colvarparams
- get_param_names() : colvarparams
- get_param_ptr() : colvarparams
- get_state_params() : colvar, colvar_grid< T >, colvar_grid_count, colvar_grid_gradient, colvar_grid_scalar, colvarbias, colvarbias_abmd, colvarbias_alb, colvarbias_meta, colvarbias_restraint, colvarbias_ti
- get_tcl_interp() : colvarproxy_tcl
- get_time_step_factor() : colvardeps
- get_value() : colvar_grid< T >
- get_vector() : colvarmodule::quaternion
- get_version_from_string() : colvarproxy
- get_volmap_id() : colvarproxy_volmaps
- get_volmap_id_from_name() : colvarproxy_namd, colvarproxy_volmaps
- get_volmap_ids() : colvar
- get_volmap_value() : colvarproxy_volmaps
- getGridForceGridValue() : colvarproxy_namd
- getInputSize() : neuralnetworkCV::denseLayer
- getLayer() : neuralnetworkCV::neuralNetworkCompute
- getline() : colvarmodule
- getline_nocomments() : colvarparse
- getNumberOfLayers() : neuralnetworkCV::neuralNetworkCompute
- getOutputSize() : neuralnetworkCV::denseLayer
- getWeight() : neuralnetworkCV::denseLayer
- global_cvc_desc_map : colvar
- global_cvc_map : colvar
- grad : colvarmodule::atom
- gradient_finite_diff() : colvar_grid_count, colvar_grid_scalar
- gradients : colvarbias_abf
- grid : colvarbias_histogram
- grid_rmsd() : colvar_grid_gradient, colvar_grid_scalar
- GridForceGridLoop() : colvarproxy_namd
- grids_freq : colvarbias_meta
- group1 : colvar::angle, colvar::coordnum, colvar::dihedral, colvar::dipole_angle, colvar::distance, colvar::distance_inv, colvar::distance_pairs, colvar::selfcoordnum
- group2 : colvar::angle, colvar::coordnum, colvar::dihedral, colvar::dipole_angle, colvar::distance, colvar::distance_inv, colvar::distance_pairs
- group3 : colvar::angle, colvar::dihedral, colvar::dipole_angle
- group4 : colvar::dihedral
- group_force_object() : colvarmodule::atom_group::group_force_object
- group_forces : colvarmodule::atom_group