Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:

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• id : colvarmodule::atom
• ids() : colvarmodule::atom_group
• incr() : colvar_grid< T >
• incr_count() : colvar_grid_count
• incr_read_pos() : cvm::memory_stream
• incr_write_pos() : cvm::memory_stream
• increase_depth() : colvarmodule
• increase_refcount() : colvarproxy_atoms
• index : colvarmodule::atom, colvarmodule::atom_group
• index_file_names : colvarmodule
• index_group_names : colvarmodule
• index_groups : colvarmodule
• index_ok() : colvar_grid< T >
• indirect_lambda_biasing_force : colvarproxy_system
• init() : colvar::alpha_angles, colvar::angle, colvar::aspath, colvar::aspathCV, colvar::azpath, colvar::azpathCV, colvar::cartesian, colvar::CartesianBasedPath, colvar::coordnum, colvar::customColvar, colvar::CVBasedPath, colvar::cvc, colvar::dihedPC, colvar::dihedral, colvar::dipole_angle, colvar::dipole_magnitude, colvar::distance, colvar::distance_inv, colvar::distance_pairs, colvar::distance_z, colvar::eigenvector, colvar::groupcoordnum, colvar::gspath, colvar::gspathCV, colvar::gyration, colvar::gzpath, colvar::gzpathCV, colvar::h_bond, colvar::inertia_z, colvar, colvar::linearCombination, colvar::map_total, colvar::neuralNetwork, colvar::orientation, colvar::polar_phi, colvar::polar_theta, colvar::rmsd, colvar::selfcoordnum, colvar::tilt, colvar::torchANN, colvarbias, colvarbias_abf, colvarbias_abmd, colvarbias_alb, colvarbias_histogram, colvarbias_meta, colvarbias_opes, colvarbias_restraint, colvarbias_restraint_centers, colvarbias_restraint_centers_moving, colvarbias_restraint_harmonic, colvarbias_restraint_harmonic_walls, colvarbias_restraint_histogram, colvarbias_restraint_k, colvarbias_restraint_k_moving, colvarbias_restraint_linear, colvarbias_reweightaMD, colvarbias_ti, colvarmodule::atom_group, colvarmodule::rotation
• init_as_angle() : colvar::cvc
• init_as_distance() : colvar::cvc
• init_as_periodic_angle() : colvar::cvc
• init_atom() : colvarproxy_atoms, colvarproxy_lammps, colvarproxy_namd, colvarproxy_vmd
• init_atom_group() : colvarproxy_atom_groups, colvarproxy_namd
• init_atoms_map() : colvarproxy_namd
• init_command() : colvarscript
• init_commands() : colvarscript
• init_components() : colvar
• init_components_type() : colvar
• init_custom_function() : colvar
• init_dependencies() : colvar::cvc, colvar, colvarbias, colvardeps, colvarmodule::atom_group
• init_extended_Lagrangian() : colvar
• init_feature() : colvardeps
• init_grid_parameters() : colvar
• init_output_flags() : colvar
• init_permutation() : colvar::rmsd
• init_scalar_boundaries() : colvar::cvc
• init_tcl_pointers() : colvarproxy_namd, colvarproxy_tcl, colvarproxy_vmd
• init_total_force_params() : colvar::cvc
• init_volmap_by_id() : colvarproxy_namd, colvarproxy_vmd, colvarproxy_volmaps
• init_volmap_by_name() : colvarproxy_namd, colvarproxy_volmaps
• initial_centers : colvarbias_restraint_centers_moving
• inner() : colvarmodule::quaternion
• inner_opt() : colvarvalue
• input_buffer() : cvm::memory_stream
• input_location() : cvm::memory_stream
• input_prefix : colvarbias_abf, colvarproxy_io
• input_prefix_str : colvarproxy_io
• input_state_buffer_ : colvarmodule
• input_stream() : colvarproxy_io
• input_stream_error_ : colvarproxy_io
• input_stream_exists() : colvarproxy_io
• input_stream_from_string() : colvarproxy_io
• input_streams_ : colvarproxy_io
• integer_power() : colvarmodule
• integral() : colvar_grid_scalar
• integrate() : integrate_potential
• integrate_iterations : colvarbias_abf
• integrate_potential() : integrate_potential
• integrate_tol : colvarbias_abf
• internal_buffer_ : cvm::memory_stream
• internal_to_angstrom() : colvarproxy_system
• interpolate() : colvarvalue
• inverse() : colvarmodule::rotation
• io_available() : colvarproxy, colvarproxy_io
• is_derivative() : colvarvalue
• is_scalar() : colvarvalue
• it : colvarbias_meta::hill, colvarmodule
• it_restart : colvarmodule
• it_width : colvarmodule