Collective Variables Module - Developer Documentation
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Class Index
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  S  
colvarbias_histogram   colvar::cvc   colvar::gyration   colvarmodule::rmatrix   
colvarbias_meta   
  d  
  h  
colvar::rmsd   
ScriptTcl   colvarbias_restraint   colvarmodule::rotation   
SimParameters   colvarbias_restraint_centers   colvar::dihedPC   colvar::h_bond   colvarmodule::matrix2d::row   
  a  
colvarbias_restraint_centers_moving   colvar::dihedral   colvarbias_meta::hill   colvarmodule::rvector   
colvarbias_restraint_harmonic   colvar::dipole_angle   
  i  
  s  
colvar::alpha_angles   colvarbias_restraint_harmonic_walls   colvar::distance   
colvar::angle   colvarbias_restraint_histogram   colvar::distance_dir   colvar::inertia   colvar::selfcoordnum   
colvarmodule::atom   colvarbias_restraint_k   colvar::distance_inv   colvar::inertia_z   colvar::spin_angle   
colvarmodule::atom_group   colvarbias_restraint_k_moving   colvar::distance_pairs   
  m  
  t  
  c  
colvarbias_restraint_linear   colvar::distance_vec   
colvarbias_restraint_moving   colvar::distance_xy   colvarmodule::matrix2d   colvar::tilt   
colvar::cartesian   colvardeps   colvar::distance_z   
  o  
  v  
colvar   colvarmodule   
  e  
colvar_grid   colvarparse   colvar::orientation   colvarmodule::vector1d   
colvar_grid_count   colvarproxy   colvar::eigenvector   colvar::orientation_angle   
colvar_grid_gradient   colvarproxy_namd   
  f  
colvar::orientation_proj   
colvar_grid_scalar   colvarproxy_vmd   
  q  
colvarbias   colvarscript   colvardeps::feature   
colvarbias_abf   colvarvalue   colvardeps::feature_state   colvarmodule::quaternion   
colvarbias_alb   colvar::coordnum   
  g  
  r  
colvar::groupcoordnum   colvarparse::read_block   
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